HMDB离线数据库转换为Excel表格

介绍HMDB All Metabolites离线数据库转换过程,将hmdb_metabolites.xml数据转换为CSV,保留Metabolite ID、Common Name等指定字段。

2026年8月1日 · 2 分钟 · IT小章

用离线HMDB数据库批量提取代谢物Chemical Taxonomy信息

使用 Python 基于离线 HMDB XML 数据库,根据 HMDB ID 批量提取 Chemical Taxonomy 分类信息,并解决 CSV 输出 PermissionError 权限错误问题。

2026年7月24日 · 3 分钟 · IT小章

Python批量筛选HMDB代谢物Detected and Quantified与Endogenous字段

客户提供数万条 HMDB 代谢物 ID,需要批量判断 Status 是否为 Detected and Quantified,以及是否为 Endogenous。通过 Python 自动化处理 ID 清洗、字段匹配与结果输出,替代人工逐条查询,提高处理效率并减少错误。

2026年5月16日 · 2 分钟 · IT小章

基于HMDB数据库批量筛选Kidney相关化合物数据

从 HMDB XML 构建 Kidney 相关 HMDB ID 命中集合,再批量过滤 Excel(.xlsx)并导出 CSV,保持原有列结构与顺序不变,同时输出统计与未命中列表。

2026年4月8日 · 5 分钟 · IT小章