自动抓取 HMDB 外源性代谢物食物来源工具
自动化抓取 HMDB 数据库中代谢物外源性来源,生成 CSV,便于科研与食物-代谢物关联分析。
自动化抓取 HMDB 数据库中代谢物外源性来源,生成 CSV,便于科研与食物-代谢物关联分析。
这是一款专为代谢组学研究设计的Python自动化工具,能够从HMDB数据库批量获取代谢物信息,包括物质分类、组织定位和相关数据库ID等关键信息,大幅提升数据收集效率。
本工具通过Python脚本,利用质谱数据中的质量数,从HMDB数据库批量提取化合物信息,包括HMDB ID、常用名称、化学式及结构图片,并将结果导出为CSV文件,极大提升代谢物注释效率。